Wydział Zastosowań Informatyki i Matematyki jest organizatorem następujących konferencji naukowych:
1. Symbioza Techniki i Informatyki jest organizowana przez Katedrę Zastosowań Informatyki SGGW w Warszawie wspólnie z Zakładem Elektrotechniki i Informatyki (ZEiI) Instytutu Techniki Uniwersytetu Rzeszowskiego od 2010 r., http://sti.ur.edu.pl/.
2. Metody Ilościowe w Badaniach Ekonomicznych jest organizowana od roku 2000. Obecnie organizowana jest przez Katedrę Ekonometrii i Statystyki. Do roku 2008 była konferencją krajową, obecnie stała się konferencją międzynarodową „Quantitative Methods in Economics”: http://www.mibe.sggw.pl.
3. Systemy Informatyczne w Zarządzaniu jest konferencją krajową organizowaną od roku 2006 przez Katedrę Informatyki poświęconą zastosowaniu technologii informatycznych: w finansach i bankowości, w dużych i średnich przedsiębiorstwach, w administracji publicznej oraz rolnictwie. Szczegółowe informacje znajdują się na stronie konferencji: http://isim.wzim.sggw.pl/.
4. International Conference on Computer Vision and Graphics ICCVG jest współorganizowana przez WZIM. Tematyką konferencji są szeroko pojęte metody przetwarzania obrazów i komunikacji z komputerem. Więcej informacji pod adresem http://iccvg.wzim.sggw.pl.
5. Multi-Conference on Advanced Computer Systems. Konferencja organizowana we współpracy: http://acs.zut.edu.pl.